Das Mangrove Lagoon Marine Reserve umfasst 85 Hektar flache Gezeitenzonen an der Südostküste von St. Thomas. Die Wurzeln der Roten Mangroven filtern täglich geschätzte 200.000 Gallonen Meerwasser. Das 1990 im Rahmen des Virgin Islands Coastal Zone Management Act gegründete Reservat schützt einen der dichtesten Mangrovenwälder der Karibik – ein Kinderstuben-Habitat, in dem junge Schnapper, Grunzer und Papageifische Schutz finden, bevor sie zu den vorgelagerten Riffen wandern. Die Lage der Lagune zwischen Bovoni Cay und Cas Cay schafft einen natürlichen Puffer gegen den Atlantikdünung und sorgt selbst dann für ruhige Paddelbedingungen, wenn in den äußeren Buchten drei Fuß hohe Wellen verzeichnet werden. Die Kajakrouten in der Mangrovenlagune von St. Thomas schlängeln sich durch Tunnel, in denen sich die Stelzwurzeln über den Köpfen wölben und das Sonnenlicht in grüne Säulen filtern. Das Reservat unterstützt 42 dokumentierte Vogelarten, darunter den Goldwaldsänger und den Graukönigstyrann, beides endemische Brutvögel. Unter der Oberfläche erreicht die Sichtweite in der Trockenzeit bis zu 40 Fuß und gibt den Blick auf Seegraswiesen frei, die das ganze Jahr über Karettschildkröten und Suppenschildkröten ernähren. Mangrove-Ökosysteme binden Kohlenstoff viermal effektiver als Landwälder – allein dieser 85 Hektar große Bestand speichert geschätzte 12.000 Tonnen Kohlenstoff in der unterirdischen Biomasse. Cas Cay, eine 12 Hektar große unbewohnte Insel innerhalb des Reservats, ist der Ankerpunkt der meisten geführten Touren. Ihr vorgelagertes Riff liegt in 4 bis 5 Metern Wassertiefe und ist nach einer 200-Meter-Paddeltour von den Startpunkten in Estate Nadir aus erreichbar. An der Nordküste der Insel befinden sich Gezeitentümpel, in denen sich bei Ebbe Sergeant-Major-Fische und junge Stopplicht-Papageifische sammeln. Zu den Korallenformationen gehören Hirnkorallenkolonien mit einem Durchmesser von über zwei Metern – Schätzungen zufolge sind die größten Exemplare 120 Jahre alt und stammen aus einer Zeit, die acht Jahrzehnte vor der offiziellen Ausweisung des Reservats liegt. Der ökologische Wert der Lagune geht über die Erholung hinaus. Forscher der University of the Virgin Islands überwachen hier vierteljährlich die Wasserqualität und verfolgen Nährstoffbelastungen sowie Sedimentmuster, die die Gesundheit der Riffe im gesamten St. Thomas East End Marine Park beeinflussen. Rote Mangroven stabilisieren 1,2 Meilen Küstenlinie und verhindern Erosion, die andernfalls die küstennahen Gewässer trüben würde. Der Bewirtschaftungsplan des Reservats beschränkt motorisierte Boote auf markierte Kanäle und bewahrt so die Seegrasdichte bei 85 Prozent Abdeckung – das Doppelte des gebietsweiten Durchschnitts. Dieser Regulierungsrahmen erhält sowohl die Artenvielfalt der Lagune als auch die Klarheit, die Kajakerlebnisse in der Mangrovenlagune von St. Thomas für Anfänger und Schnorchler möglich macht.